Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSP16219 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSP16219 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSP16219 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSP16219 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSP16219 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSP16219 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSP16219 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSP16219 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSP16219 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSP16219 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSP16219 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSP16219 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSP16219 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSP16219 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSP16219 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSP16219 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSP16219 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSP16219 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSP16219 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSP16219 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACADSP16219 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACADSP16219 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSP16219 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSP16219 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSP16219 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSP16219 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSP16219 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACADSP16219 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACADSP16219 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSP16219 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSP16219 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSP16219 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSP16219 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSP16219 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSP16219 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSP16219 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACADSP16219 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSP16219 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms