Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD44P16070 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD44P16070 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD44P16070 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD44P16070 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD44P16070 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD44P16070 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD44P16070 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD44P16070 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD44P16070 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD44P16070 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD44P16070 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CD44P16070 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD44P16070 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD44P16070 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD44P16070 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD44P16070 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD44P16070 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD44P16070 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD44P16070 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD44P16070 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD44P16070 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CD44P16070 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD44P16070 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD44P16070 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD44P16070 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD44P16070 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD44P16070 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms