Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VEGFAP15692 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms