Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXB1P14653 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXB1P14653 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms