Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL5P13501 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL5P13501 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL5P13501 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL5P13501 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL5P13501 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL5P13501 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCL5P13501 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCL5P13501 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCL5P13501 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCL5P13501 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCL5P13501 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCL5P13501 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL5P13501 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL5P13501 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL5P13501 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL5P13501 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL5P13501 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL5P13501 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL5P13501 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL5P13501 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL5P13501 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL5P13501 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL5P13501 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL5P13501 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL5P13501 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL5P13501 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL5P13501 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL5P13501 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL5P13501 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL5P13501 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL5P13501 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL5P13501 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL5P13501 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL5P13501 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL5P13501 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL5P13501 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL5P13501 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL5P13501 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL5P13501 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL5P13501 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms