Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXD8P13378 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXD8P13378 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXD8P13378 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms