Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2P10911 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2P10911 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2P10911 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2P10911 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2P10911 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2P10911 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2P10911 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2P10911 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2P10911 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2P10911 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2P10911 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2P10911 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2P10911 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2P10911 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2P10911 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2P10911 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2P10911 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2P10911 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2P10911 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2P10911 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2P10911 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2P10911 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2P10911 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2P10911 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2P10911 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2P10911 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2P10911 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCF2P10911 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCF2P10911 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCF2P10911 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2P10911 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2P10911 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2P10911 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2P10911 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2P10911 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2P10911 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2P10911 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2P10911 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2P10911 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2P10911 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2P10911 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2P10911 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2P10911 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2P10911 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2P10911 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2P10911 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2P10911 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2P10911 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2P10911 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2P10911 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2P10911 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms