Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GLI4P10075 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GLI4P10075 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GLI4P10075 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GLI4P10075 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GLI4P10075 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GLI4P10075 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GLI4P10075 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GLI4P10075 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GLI4P10075 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GLI4P10075 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GLI4P10075 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GLI4P10075 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms