Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIL1P09327 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIL1P09327 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VIL1P09327 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VIL1P09327 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIL1P09327 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIL1P09327 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VIL1P09327 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VIL1P09327 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIL1P09327 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIL1P09327 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIL1P09327 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIL1P09327 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIL1P09327 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VIL1P09327 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VIL1P09327 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIL1P09327 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIL1P09327 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIL1P09327 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIL1P09327 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VIL1P09327 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VIL1P09327 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VIL1P09327 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VIL1P09327 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VIL1P09327 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VIL1P09327 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIL1P09327 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIL1P09327 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIL1P09327 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIL1P09327 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIL1P09327 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIL1P09327 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIL1P09327 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VIL1P09327 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIL1P09327 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIL1P09327 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIL1P09327 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIL1P09327 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIL1P09327 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VIL1P09327 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VIL1P09327 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIL1P09327 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIL1P09327 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIL1P09327 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIL1P09327 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIL1P09327 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIL1P09327 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VIL1P09327 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VIL1P09327 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms