Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB5P09067 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB5P09067 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms