Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI1P08151 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI1P08151 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI1P08151 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI1P08151 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI1P08151 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI1P08151 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GLI1P08151 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI1P08151 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI1P08151 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI1P08151 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI1P08151 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI1P08151 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI1P08151 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI1P08151 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI1P08151 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI1P08151 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI1P08151 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI1P08151 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI1P08151 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI1P08151 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI1P08151 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI1P08151 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI1P08151 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI1P08151 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI1P08151 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI1P08151 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI1P08151 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI1P08151 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI1P08151 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI1P08151 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI1P08151 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GLI1P08151 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI1P08151 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI1P08151 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI1P08151 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI1P08151 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI1P08151 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI1P08151 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI1P08151 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI1P08151 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GLI1P08151 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLI1P08151 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GLI1P08151 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms