Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NGFRP08138 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NGFRP08138 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NGFRP08138 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NGFRP08138 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NGFRP08138 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NGFRP08138 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NGFRP08138 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NGFRP08138 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NGFRP08138 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NGFRP08138 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NGFRP08138 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NGFRP08138 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NGFRP08138 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NGFRP08138 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NGFRP08138 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms