Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CENPBP07199 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CENPBP07199 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CENPBP07199 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CENPBP07199 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CENPBP07199 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CENPBP07199 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CENPBP07199 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPBP07199 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPBP07199 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPBP07199 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPBP07199 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPBP07199 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPBP07199 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPBP07199 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CENPBP07199 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPBP07199 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPBP07199 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPBP07199 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPBP07199 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPBP07199 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPBP07199 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPBP07199 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CENPBP07199 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CENPBP07199 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CENPBP07199 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CENPBP07199 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CENPBP07199 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CENPBP07199 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CENPBP07199 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CENPBP07199 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CENPBP07199 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CENPBP07199 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CENPBP07199 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CENPBP07199 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CENPBP07199 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CENPBP07199 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CENPBP07199 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CENPBP07199 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CENPBP07199 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CENPBP07199 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CENPBP07199 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CENPBP07199 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CENPBP07199 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CENPBP07199 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CENPBP07199 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CENPBP07199 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CENPBP07199 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CENPBP07199 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CENPBP07199 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CENPBP07199 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CENPBP07199 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CENPBP07199 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CENPBP07199 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CENPBP07199 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CENPBP07199 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CENPBP07199 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CENPBP07199 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CENPBP07199 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CENPBP07199 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CENPBP07199 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CENPBP07199 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CENPBP07199 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CENPBP07199 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CENPBP07199 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CENPBP07199 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CENPBP07199 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CENPBP07199 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CENPBP07199 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CENPBP07199 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CENPBP07199 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CENPBP07199 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms