Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAVP06756 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAVP06756 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAVP06756 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms