Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCBP05771 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCBP05771 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCBP05771 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms