Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGAP02671 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGAP02671 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGAP02671 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGAP02671 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGAP02671 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGAP02671 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FGAP02671 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGAP02671 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGAP02671 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGAP02671 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGAP02671 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FGAP02671 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
FGAP02671 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FGAP02671 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGAP02671 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGAP02671 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGAP02671 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGAP02671 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGAP02671 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGAP02671 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGAP02671 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGAP02671 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGAP02671 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGAP02671 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGAP02671 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGAP02671 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGAP02671 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGAP02671 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGAP02671 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGAP02671 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGAP02671 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGAP02671 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGAP02671 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGAP02671 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGAP02671 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGAP02671 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGAP02671 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGAP02671 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms