Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD4P01730 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD4P01730 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD4P01730 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD4P01730 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD4P01730 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CD4P01730 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD4P01730 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD4P01730 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD4P01730 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD4P01730 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD4P01730 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD4P01730 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD4P01730 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD4P01730 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD4P01730 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD4P01730 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD4P01730 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD4P01730 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD4P01730 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD4P01730 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD4P01730 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD4P01730 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD4P01730 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD4P01730 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CD4P01730 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD4P01730 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD4P01730 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD4P01730 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD4P01730 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD4P01730 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD4P01730 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CD4P01730 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CD4P01730 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD4P01730 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD4P01730 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD4P01730 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD4P01730 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD4P01730 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD4P01730 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD4P01730 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD4P01730 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD4P01730 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD4P01730 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms