Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSP01100 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSP01100 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSP01100 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOSP01100 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOSP01100 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSP01100 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSP01100 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSP01100 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSP01100 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSP01100 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSP01100 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSP01100 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSP01100 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSP01100 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSP01100 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSP01100 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSP01100 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSP01100 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSP01100 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSP01100 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSP01100 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSP01100 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSP01100 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSP01100 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSP01100 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSP01100 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSP01100 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSP01100 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSP01100 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSP01100 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSP01100 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSP01100 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSP01100 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSP01100 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSP01100 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSP01100 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSP01100 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSP01100 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSP01100 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSP01100 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSP01100 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSP01100 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSP01100 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms