Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD3O95983 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD3O95983 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD3O95983 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD3O95983 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD3O95983 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD3O95983 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD3O95983 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MBD3O95983 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD3O95983 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD3O95983 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD3O95983 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MBD3O95983 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD3O95983 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD3O95983 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD3O95983 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD3O95983 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD3O95983 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD3O95983 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD3O95983 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MBD3O95983 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD3O95983 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD3O95983 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD3O95983 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD3O95983 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MBD3O95983 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD3O95983 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD3O95983 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD3O95983 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD3O95983 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD3O95983 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD3O95983 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MBD3O95983 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD3O95983 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD3O95983 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD3O95983 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD3O95983 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD3O95983 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MBD3O95983 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MBD3O95983 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MBD3O95983 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MBD3O95983 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MBD3O95983 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD3O95983 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD3O95983 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD3O95983 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD3O95983 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD3O95983 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MBD3O95983 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MBD3O95983 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD3O95983 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD3O95983 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD3O95983 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD3O95983 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD3O95983 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MBD3O95983 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MBD3O95983 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MBD3O95983 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MBD3O95983 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms