Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRUB2O95900 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRUB2O95900 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRUB2O95900 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms