Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RAPGEF3O95398 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAPGEF3O95398 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms