Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG7O95352 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG7O95352 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG7O95352 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG7O95352 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG7O95352 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG7O95352 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG7O95352 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG7O95352 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG7O95352 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG7O95352 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG7O95352 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG7O95352 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG7O95352 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG7O95352 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG7O95352 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG7O95352 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG7O95352 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG7O95352 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG7O95352 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG7O95352 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG7O95352 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG7O95352 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG7O95352 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG7O95352 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG7O95352 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG7O95352 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG7O95352 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG7O95352 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG7O95352 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG7O95352 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG7O95352 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG7O95352 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG7O95352 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG7O95352 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG7O95352 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG7O95352 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG7O95352 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG7O95352 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG7O95352 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG7O95352 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms