Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIX3O95343 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIX3O95343 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIX3O95343 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SIX3O95343 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SIX3O95343 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX3O95343 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX3O95343 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX3O95343 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX3O95343 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX3O95343 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX3O95343 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX3O95343 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX3O95343 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIX3O95343 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIX3O95343 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIX3O95343 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIX3O95343 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SIX3O95343 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms