Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC31AO94979 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms