Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH1A2O94788 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH1A2O94788 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms