Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKL5O76039 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDKL5O76039 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL5O76039 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms