Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIOO75962 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOO75962 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOO75962 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOO75962 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOO75962 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOO75962 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOO75962 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIOO75962 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIOO75962 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIOO75962 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIOO75962 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIOO75962 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOO75962 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOO75962 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOO75962 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOO75962 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIOO75962 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIOO75962 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIOO75962 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIOO75962 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIOO75962 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOO75962 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOO75962 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOO75962 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOO75962 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOO75962 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOO75962 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIOO75962 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOO75962 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOO75962 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOO75962 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOO75962 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIOO75962 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms