Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BANF1O75531 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BANF1O75531 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BANF1O75531 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BANF1O75531 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BANF1O75531 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BANF1O75531 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BANF1O75531 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BANF1O75531 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BANF1O75531 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BANF1O75531 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BANF1O75531 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BANF1O75531 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BANF1O75531 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BANF1O75531 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BANF1O75531 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BANF1O75531 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BANF1O75531 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BANF1O75531 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BANF1O75531 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BANF1O75531 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BANF1O75531 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BANF1O75531 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BANF1O75531 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BANF1O75531 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BANF1O75531 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BANF1O75531 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BANF1O75531 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BANF1O75531 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BANF1O75531 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BANF1O75531 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BANF1O75531 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BANF1O75531 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BANF1O75531 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BANF1O75531 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BANF1O75531 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BANF1O75531 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BANF1O75531 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BANF1O75531 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BANF1O75531 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BANF1O75531 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BANF1O75531 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BANF1O75531 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BANF1O75531 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms