Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR5O75473 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR5O75473 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR5O75473 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR5O75473 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LGR5O75473 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGR5O75473 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGR5O75473 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGR5O75473 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGR5O75473 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LGR5O75473 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LGR5O75473 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LGR5O75473 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR5O75473 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR5O75473 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR5O75473 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR5O75473 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR5O75473 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR5O75473 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR5O75473 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR5O75473 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LGR5O75473 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LGR5O75473 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR5O75473 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR5O75473 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR5O75473 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR5O75473 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR5O75473 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR5O75473 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR5O75473 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR5O75473 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR5O75473 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR5O75473 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR5O75473 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR5O75473 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR5O75473 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR5O75473 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR5O75473 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR5O75473 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR5O75473 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR5O75473 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR5O75473 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR5O75473 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR5O75473 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR5O75473 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR5O75473 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR5O75473 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR5O75473 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR5O75473 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms