Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAMP4O75379 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
VAMP4O75379 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms