Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP12O75317 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP12O75317 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP12O75317 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP12O75317 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP12O75317 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP12O75317 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP12O75317 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP12O75317 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP12O75317 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP12O75317 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP12O75317 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP12O75317 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP12O75317 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP12O75317 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP12O75317 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP12O75317 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP12O75317 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP12O75317 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP12O75317 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP12O75317 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP12O75317 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP12O75317 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP12O75317 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP12O75317 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP12O75317 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP12O75317 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP12O75317 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP12O75317 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP12O75317 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP12O75317 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP12O75317 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP12O75317 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP12O75317 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP12O75317 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP12O75317 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP12O75317 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP12O75317 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP12O75317 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP12O75317 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP12O75317 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP12O75317 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP12O75317 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP12O75317 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP12O75317 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP12O75317 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP12O75317 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP12O75317 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP12O75317 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP12O75317 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP12O75317 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms