Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF4O60810 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF4O60810 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms