Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF10O60809 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF10O60809 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms