Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GFRA3O60609 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GFRA3O60609 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms