Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR5O60602 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR5O60602 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR5O60602 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR5O60602 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR5O60602 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR5O60602 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR5O60602 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR5O60602 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR5O60602 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR5O60602 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR5O60602 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR5O60602 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR5O60602 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR5O60602 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR5O60602 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR5O60602 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR5O60602 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR5O60602 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR5O60602 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR5O60602 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLR5O60602 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR5O60602 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR5O60602 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR5O60602 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR5O60602 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR5O60602 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR5O60602 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR5O60602 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR5O60602 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR5O60602 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR5O60602 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR5O60602 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR5O60602 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR5O60602 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR5O60602 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR5O60602 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR5O60602 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR5O60602 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR5O60602 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR5O60602 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR5O60602 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR5O60602 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR5O60602 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR5O60602 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR5O60602 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR5O60602 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR5O60602 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR5O60602 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR5O60602 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR5O60602 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLR5O60602 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLR5O60602 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLR5O60602 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLR5O60602 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms