Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREM1O60565 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREM1O60565 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREM1O60565 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREM1O60565 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREM1O60565 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREM1O60565 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREM1O60565 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREM1O60565 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREM1O60565 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GREM1O60565 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREM1O60565 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREM1O60565 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREM1O60565 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GREM1O60565 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREM1O60565 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREM1O60565 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREM1O60565 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREM1O60565 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREM1O60565 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREM1O60565 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GREM1O60565 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GREM1O60565 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GREM1O60565 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREM1O60565 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREM1O60565 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREM1O60565 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREM1O60565 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREM1O60565 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GREM1O60565 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GREM1O60565 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREM1O60565 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREM1O60565 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREM1O60565 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREM1O60565 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREM1O60565 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREM1O60565 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREM1O60565 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREM1O60565 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GREM1O60565 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GREM1O60565 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREM1O60565 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREM1O60565 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREM1O60565 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREM1O60565 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GREM1O60565 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREM1O60565 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GREM1O60565 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GREM1O60565 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREM1O60565 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREM1O60565 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREM1O60565 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREM1O60565 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREM1O60565 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GREM1O60565 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms