Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXD2O60548 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms