Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MARCH6O60337 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH6O60337 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH6O60337 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms