Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALUO43852 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALUO43852 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALUO43852 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALUO43852 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALUO43852 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALUO43852 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALUO43852 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALUO43852 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALUO43852 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALUO43852 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALUO43852 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALUO43852 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALUO43852 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALUO43852 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALUO43852 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALUO43852 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALUO43852 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALUO43852 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALUO43852 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALUO43852 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALUO43852 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CALUO43852 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CALUO43852 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CALUO43852 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALUO43852 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALUO43852 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALUO43852 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALUO43852 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALUO43852 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALUO43852 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALUO43852 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CALUO43852 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALUO43852 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALUO43852 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALUO43852 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALUO43852 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALUO43852 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALUO43852 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALUO43852 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALUO43852 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALUO43852 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALUO43852 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALUO43852 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALUO43852 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms