Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATCO43716 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATCO43716 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATCO43716 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATCO43716 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATCO43716 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATCO43716 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATCO43716 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATCO43716 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms