Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KCNQ3O43525 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNQ3O43525 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms