Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRGAP3O43295 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms