Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT1O43278 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPINT1O43278 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINT1O43278 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms