Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRXO43186 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRXO43186 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CRXO43186 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRXO43186 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRXO43186 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRXO43186 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRXO43186 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRXO43186 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CRXO43186 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CRXO43186 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CRXO43186 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CRXO43186 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRXO43186 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRXO43186 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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