Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBTB39O15060 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZBTB39O15060 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZBTB39O15060 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBTB39O15060 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms