Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHOX2AO14813 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHOX2AO14813 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms