Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
POLR3AO14802 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR3AO14802 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR3AO14802 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms