Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
APAF1O14727 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APAF1O14727 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APAF1O14727 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APAF1O14727 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
APAF1O14727 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APAF1O14727 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
APAF1O14727 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APAF1O14727 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
APAF1O14727 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
APAF1O14727 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APAF1O14727 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APAF1O14727 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
APAF1O14727 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
APAF1O14727 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APAF1O14727 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
APAF1O14727 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
APAF1O14727 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
APAF1O14727 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
APAF1O14727 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APAF1O14727 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APAF1O14727 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APAF1O14727 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APAF1O14727 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
APAF1O14727 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
APAF1O14727 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
APAF1O14727 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APAF1O14727 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
APAF1O14727 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
APAF1O14727 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
APAF1O14727 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms