Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRIT1O00522 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRIT1O00522 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms