Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GFRA2O00451 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms